viernes, 11 de noviembre de 2022

Configuración de los datos en Prometa 3 (v. 3.0.0)

Antes de configurar los datos de los outcomes (resultados cuantitativos que reflejan los estudios que formarán parte del meta-análisis) es preciso haber insertado la identificación de cada uno de los estudios en la pestaña Studies [Estudios] [Paso anterior]. Prometa 3 (versión 3.0.0 / año 2022) incluye en Data Entry Type [Tipo de entrada de información] un gran abanico de opciones en forma de árbol despegable para poder introducir de manera sencilla el tipo de datos de los outcomes que ofrece cada uno de los estudios, independientemente de su propia naturaleza.

Es posible que tengamos que invocar la opción (ES) Effect size templates [Plantillas del tamaño del efecto] desde el menú principal en la opción Window (Ventana), tal y como se muestra en la siguiente imagen. Conviene recordar que independientemente del sistema operativo que usemos (Windows, Linux o MacOS), el menú principal se encuentra en la parte superior de la ventana del programa.




A continuación, debemos hacer clic en la pestaña (ES) Effect size templates [Plantillas del tamaño de efecto] para que aparezca el árbol con todas las opciones bajo el nombre Data entry types [Tipos de entrada de datos]. A este respecto, es interesante que la pestaña Studies [Estudios] esté en la parte izquierda puesto que tendremos que arrastrar el tipo de dato o estadístico que queramos introducir del árbol al estudio objeto de análisis, tal y como se muestra en la siguiente imagen.




Llegados a este punto, es imprescindible saber la naturaleza de los estudios objeto de análisis y del tipo de datos que incluyen. En función de este tipo de datos o estadísticos, seleccionaremos una determinada opción del árbol de (ES) Effect size templates [Plantilla del tamaño de efecto] de la carpeta principal Data entry Types [Tipos de entrada de datos]. Una vez sepamos el tipo de dato (estadístico) que tenemos que introducir en cada uno de los estudios, lo arrastraremos a la opción de outcome que hemos configurado anteriormente en la columna de Studies [Estudios].

  • Supongamos el siguiente ejemplo ficticio. Hemos seleccionado de una base de datos ocho estudios que investigan un nuevo fármaco para prevenir los ataques de pánico. En estos estudios, los resultados se presentan en forma de evento / no evento. Es decir, se señala la cantidad de veces que ocurre el outcome [resultado] objeto de estudio (ataques de pánico) en el grupo experimental y en el grupo control. 
  • La naturaleza de nuestros estudios nos indica que tenemos que introducir el número de eventos y el tamaño muestra de cada grupo. Entonces, nos desplazaremos por el árbol (ES) Effect size template y Data entry types a Binary data [Información o datos binarios], a Binary data, two independent groups, prospective [Datos binarios, dos grupos independientes, prospectivos] y, finalmente, a Events, sample size [Eventos, tamaño muestra]. Ahora lo que haremos es arrastrar Events, sample size al outcome Panic attack del primer estudio, tal y como se refleja en la siguiente imagen.


Nota importante. En la siguiente entrada podrás acceder a una guía completa que incluye información de cada una de las opciones que ofrece el árbol (ES) Effect size template para que puedas saber rápidamente qué tipo de outcomes se deberá introducir en cada estudio en el meta-análisis.


Con esto veremos que ya está asociado el tipo de dato (estadístico) con el outcome debajo del estudio.




Haciendo clic sobre (ES) Effect size [Tamaño del efecto] podremos acceder al Effect size editor [Editor de datos del tamaño del efecto] para introducir los resultados del primer estudio. Para el ejemplo que estamos tratando, al haber seleccionado Events, sample size [Eventos, tamaño muestral] los datos que tenemos que extraer del primer estudio será el número de veces que el grupo experimental y control han tenido ataques de pánico, así como el tamaño muestra de ambos grupos. Cuando hayamos introducido los datos necesarios; que deberán estar disponibles en el estudio objeto de estudio, normalmente en el apartado "Resultados"; haremos clic en Save [Guardar]. En la parte derecha, para este ejemplo, Prometa 3 nos calcula información útil tal como el Odd ratio.




Volviendo un paso atrás, si arrastramos el tipo de datos (por ejemplo, el Event, sample size) a la carpeta superior de Studies [Estudios], se asociará dicho tipo de datos de manera automática a todos los estudios que hemos introducido. Por supuesto, esto solo será posible siempre y cuando todos los estudios objeto de estudio incluyen el mismo tipo de resultados (como en nuestro ejemplo, que todos han incluido el número de veces que se presenta el outcome objeto de estudio). Además, si se opta por esta opción, se debe recordar que hay que haber introducido anteriormente todos los estudios en su columna correspondiente [Paso anterior]. 




Por último, destacar que si se hace clic en cada moderador dentro de la columna Studies [Estudio], es posible insertar el dato de cada uno de los moderadores que se han configurado anteriormente. Para guardar el dato, se debe hacer clic en Save [Guardar] una vez incorporado el dato o las posibles anotaciones.  





Jacob Sierra Díaz

jueves, 10 de noviembre de 2022

Configuración de los estudios en Prometa 3 (v. 3.0.0.)

Una vez visto cómo crear un nuevo proyecto, cómo crear el primer outcome y cómo configurar los outcomes, llega el momento de configurar los estudios (Studies). Como su propio nombre indica, los estudios son los elementos básicos objeto de estudio en el meta-análisis. En esencia, sirven para identificar los efectos que se observen en la interpretación de resultados. Normalmente, los programas de mata-análisis permiten introducir la información de cada estudio en forma de taba. Sin embargo, en Prometa 3 (versión 3.0.0 / año 2022) esto se hace en forma de columnas.

Los estudios (studies) en Prometa 3 se deben crear individualmente en la columna de Studies. Para crear el primer estudio haremos clic con el botón derecho del ratón sobre Studies y clic en (+) Define new study.



A continuación, aparecerá una ventana emergente para indicar el nombre del estudio (Study name), que normalmente se identifica con el apellido del primer autor, el año (Publication year) y el tipo de publicación (Publication type). Para finalizar este paso, daremos clic al botón Define.



Ahora veremos que el nuevo estudio introducido aparecerá debajo de Studies. Por defecto, vendrá asociado a los Moderadores (Moderators) que hayamos creado anteriormente. Lo que tenemos que hacer es arrastrar el/los resultado(s) (Outcome(s)) al estudio para poder introducir los valores asociados a dicho estudio. Esto es lo más diferente de Prometa 3 frente a otros softwares de meta-análisis. La interfaz de Prometa 3 se vasa en columnas mientras que otros programas se basan en tablas u hojas de datos tradicionales. En nuestro caso, solo tenemos un outcome (Panic attacks), que arrastraremos al primer estudio.



En esencia, estos son los pasos básicos que se deben seguir para cada uno de los nuevos estudios que incorporemos: (+) Define new study - Designación de un nombre - Arrastramos el outcome al estudio. Es posible arrastrar de una vez el outcome deseable a todos los estudios (sin necesidad de ir arrastrando uno por uno). Para ello, debemos introducir todos los estudios y, a continuación, arrastraremos el outcome a la parte superior de la columna, en Studies. De esta forma, de manera automática se asocia el/los outcome(s) a todos los estudios creados.




Jacob Sierra Díaz

miércoles, 9 de noviembre de 2022

Configuración básica de moderadores en Prometa (v. 3.0.0)

En esencia, un moderador (moderator) no es más que una variable que puede explicar las diferencias del tamaño del efecto de nuestro análisis. Básicamente, si el moderador es una variable categórica, el efecto se examina a través de análisis por subgrupos. Por el contrario, si el moderador es una variable continua, el efecto se analizará con técnicas de meta-regresión.
El siguiente paso que daremos en Prometa 3 (versión 3.0.0 / año 2022) será el de configurar los moderadores objeto de estudio.

Para ello, vamos a definir de antemano los moderadores de nuestro ejemplo: año de publicación del estudio (por defecto), tipo de publicación (por defecto) y edad media de los participantes de cada estudio. A la hora de invocar los moderadores, Prometa 3 por defecto incluye dos: año de publicación (publication year) y el tipo de publicación (publication type). Para verlos, simplemente haremos clic, en el menú de Variables (Variables), sobre Moderators. Aquí, será posible cambiar el nombre del moderador haciendo clic en el nombre del moderador que se quiera cambiar. El cambio se deberá hacer en la ventana de Moderator Editor.



Podemos añadir nuevos moderadores haciendo clic con el botón derecho del ratón sobre Moderators. Para crear una nuevo moderador tendremos que saber el tipo de variable que es. El programa define tres tipos distintos de variables:
  • Define new categorical moderator (Definir nuevo moderador categórico). Variables que se distribuyen por categorías.
  • Define new numerical decimal moderator (Definir nuevo moderador numérico decimal). Variables cuantitativas con decimales.
  • Define new numerical integer moderator (Definir nuevo moderador numérico integral). Variables cuantitativas enteras (sin decimales).

En nuestro ejemplo, crearemos un moderador numérico decimal (Define new numerical decimal moderator) porque nuestro moderador será la edad media de la muestra.



Finalmente, debemos de poner el nombre al nuevo moderador. Ahora aparecerá debajo de Moderators.







Jacob Sierra Díaz

martes, 8 de noviembre de 2022

Configuración básica de outcomes en Prometa 3 (v. 3.0.0)

Anteriormente hemos aprendido a crear un nuevo proyecto o base de datos en el software Prometa 3 (versión 3.0.0 / año 2022). Recordamos que el programa denomina a la base de datos propiamente dicha con la palabra "tema" (topic). El siguiente paso que debemos dar para seguir confeccionando la base de datos es el de establecer los resultados (outcomes) objeto de nuestro meta-análisis. En el seno de Prometa, podemos definir outcome a los resultados objeto de nuestro estudio. Para ello, debemos activar en el menú lateral izquierdo la columna de (V) Variables.

A continuación, con el botón derecho del ratón hacemos clic en Outcomes. Haremos clic en la opción que aparece: (+) Define new Outcome. 

Variable - Outcomes - (botón derecho ratón) - Define new Outcome


La siguiente ventana nos invita a poner un nombre al resultado (outcome). Para este ejemplo, queremos analizar los ataques de pánico de varios estudios comparativos sobre la administración de un nuevo fármaco. Entonces, nuestro resultado principal será "Ataques de pánico" (o en inglés, Panic attacks). Una vez creado el nuevo outcome, podremos acceder a él desde la columna de Variables, debajo de Outcomes.


A continuación, especificaremos la información de nuestro outcome. Para ello, hacemos clic sobre el nombre del Outcome que hemos creado y completamos los campos. 

En este ejemplo, tenemos un grupo experimental y otro control.

Por último, podremos ver una síntesis de todos los outcomes (resultados objeto de estudio) configurados. En este ejemplo, como solo hemos puesto un único outcome, nos aparecerá una única fila. Para ello, bastará con hacer clic sobre Outcomes.




Jacob Sierra Díaz

lunes, 7 de noviembre de 2022

Crear nuevo proyecto en Prometa 3 (v. 3.0.0)

Una vez que hemos visto las características principales del programa Prometa 3 (versión 3.0.0 / año 2022) y aprendido a instalarlo en los ordenadores, vamos a comenzar a aprender a usarlo paso por paso. De acuerdo con la configuración del software, lo primero que tendremos que hacer es crear un nuevo tema (topic) o proyecto. Recordemos que Prometa 3 es un software que está exclusivamente en inglés. Sin embargo, se trata de una interfaz relativamente sencilla e intuitiva de usar para la comunidad hispanohablante. 

Para ello pulsaremos en el icono OT (Open Topic). En este software se denomina Topic (tema) al proyecto general donde introduciremos los datos y haremos nuestro meta-análisis. Como es la primera vez que usamos el programa, debemos crear un nuevo tema (create topic). 


En la ventana que aparece deberemos seleccionar el tipo de estudio que queríamos analizar. Existen dos tipos de temas: para dos grupos (grupo control y grupo experimental) [two groups / variables synthesis] o solo para uno (grupo de intervención) [one group / variable synthesis]. Además, es posible importar un proyecto que tengamos guardado en el ordenador en la tercera opción [Open existing topic from the database]. 

Para este ejemplo vamos a seleccionar la primera opción [two groups / variable synthesis], ya que el meta-análisis que deseamos hacer consiste en la comparación de los grupos experimentales y controles de los estudios objeto de estudio. Pulsamos sobre el botón Next.


A continuación, en la siguiente ventana tendremos que ponder el nombre del tema (nuestro proyecto)  en Topic name. También es posible escribir una nota descriptiva del proyecto que nos ayude a identificarlo en Annotations. Pulsamos sobre la tecla Finish.


El nombre del tema puesto (en este ejemplo Panic attack) aparecerá en la parte de arriba. Ahora ya podemos pasar a confeccionar la base con las variables objeto de estudio.



Jacob Sierra Díaz